huh? wtf no no...
el usb 1.1 y el 2.0 son diferentes standards, el 2.0 es 40 veces mas rapido que el 1.1
el 1.1 puede llegar a 12Mbps y el 2.0 puede ser usado a 480Mbps, (osea que no tiene nada que ver con windows)
ahora, haga esto, vayase al device manager y fijese si tiene algo asi como "enhanced usb controller" y un par de "usb controller" si esta asi entonces todo esta bien (aunque esta shit podria cambiar dependiendo de su mobo o.O)... si no le aparece el enhanced usb controller tons algo esta fallando, los otros 2 usb controller que le salen son para el backwards compatibility, para que los componentes que son 1.0 y 1.1 le funcionen en su 2.0....
y por ultimo, como se dio cuenta que solo 2 de los 8 puertos le funcionan en 2.0?
chequee el manual de la tarjeta madre, y trate desactivando la opcion que dice "usb 1.1 emulation"
(RTFM)