vCore es el voltage del procesador, que no es nada conveniente cambiar dentro de Windows. Mejor overclockee desde el BIOS, y use la aplicación de MSI nada más para verificar que el overclock esta corriendo a la velocidad deseada.
El CPU fan no tiene que ver con VCore. Lo que supongo que paso es que el voltage se redujo a un nivel tan bajo que el fan del CPU, que probablemente tiene un sensor de temperatura, detecto una disminución masiva de calor (el VCore es el responsable de la mayoría del calor del CPU) y redujo los RPMs. Aunque esto no se supone que deba pasar, mas bien que la compu se le pegue o reinicie sola
En todo caso, si va a overclockear mejor hágalo desde el BIOS. Y si por algún motivo la compu deja de postear (no prende y empieza a dar beeps), nada más resetee la batería del CMOS